多馬福音是神學上的一個重大發現：因為多馬福音的發現，有可能證明現時新約聖經的四福音書都源自同一個來源。現時神學家推斷四福音書的內容都來自同一個來源。

　　多馬福音的科普特語（Coptic）版本於1945年在埃及的Nag Hammadi發現，但當其內容被翻譯出來以後，考古學家才意會到早在1898年之時，其希臘文部分原文已在Oxyrhynchus出土，相信是Nag Hammadi版本的古本。根據考古學家推斷，希臘文版本應在約西元200年成書，而科普特語版本則在西元340年左右。

　　多馬福音和四福音書的最大分別，在於多馬福音除了聲稱是由耶穌的十二位門徒之一的使徒多馬所寫以外，全卷書只是記錄了耶穌的言行，並沒有提及他的生平。而且有部分內容是多馬福音獨有的。根據內容推斷，多馬福音的成書日期約在西元60年，比現時四福音書成書最早的馬可福音還要早。

　　不過，近年不少研究指出，多馬福音其實是偽經，也就是說，是後人所寫，而假託古人之名，而且內容和聖經的教義相違背。其中一個證據，是多馬福音發掘出來時，是與其他偽經一起被發現的。但是也有不同意見，比如金陵協和神學院的田童心先生在《神學的覺悟》一書中就認為應當把《多馬福音》與諾斯替（靈智派）玄學思想作一個區分，《多馬福音》的思想其實具有寶貴的人文主義價值。拿戈瑪第經集的發現革命性地改變了以往對於早期基督教會的研究主要依賴教父文獻的狀況。語錄體的《多馬福音》的出現證明了多年來學術界所猜想的早期口傳福音資料的確實存在。根據孫善玲先生研究，《多馬福音》已經被美國數百位新約聖經學者加盟的“耶穌研究會”列為值得信賴的關涉耶穌信仰的“第五福音”。1996年他們出版了《五福音》（The Five Gospels）。